قامت شركة آبل فعلا بإصدار نسختين محسنتين من تحديث iOS 9.3 لإصلاح بعض المشاكل المتعلقة بالتفعيل في بعض هواتف iPhone ولوحيات iPad القديمة. ومع ذلك، فلا تزال هناك بعض القضايا العالقة في تحديث iOS 9.3 الجديد.
واحدة من القضايا التي لا تزال موجودة في تحديث iOS 9.3 هي ذات صلة بالروابط في المتصفح Safari بحيث يتوقف iPhone أو iPad عن العمل عند الضغط فوق وصلة على شبكة الإنترنت. وتجدر الإشارة إلى أن هذه المشكلة لا تقتصر على المتصفح Safari، وإنما تؤثر أيضا على المتصفح Google Chrome وتطبيقات أخرى تشمل تطبيق الرسائل، والملاحظات، فضلا عن مجموعة من التطبيقات الأخرى عندما يتم الضغط على الروابط داخل هذه التطبيقات، وهذه الروابط تتسبب إما في تعطيل التطبيق أو تجعله لا يستجيب.